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技术文章 / article
【连载-企业参考品】 神经胶质瘤的诊断参考品的选择
原载自:www.co-bioer.com[技术资料频道] 2020-07-03 浏览次数:1658
科佰生物作为一家提供企业核酸诊断标准品的企业,在该领域已经深耕多年,与全国该领域90%的企业都有过合作,成功支持过很多企业的试剂盒研发和获批,在该领域有丰富的经验。根据我们对市场的调研,对客户需求的理解,我们把我们的产品线划分为多个模块,主要为支持PCR的单点Mutation、Fusion和CNV产品,支持NGS的小panel和大panel(泛肿瘤、包含TMB和MSI)产品,支持IHC和FISH的FFPE block产品,支持标准品定标的dPCR检测试剂盒产品等。
接下来的几期,我们陆续会针对不同的肿瘤,遵循NCCN指南的标注,为大家分享我们对企业参考品选择的看法。
中枢神经系统肿瘤中85%生长于颅内;15%生长于椎管内。颅内肿瘤以胶质瘤多(占42%),椎管内肿瘤以神经鞘膜瘤多(占48%);脑膜瘤次之(占15~18%),垂体腺瘤、先天性肿瘤、血管性肿瘤及其他肿瘤均在10%以下。
神经胶质瘤简称胶质瘤,也称为胶质细胞瘤,是常见的原发性中枢神经系统肿瘤,约占所有颅内原发肿瘤的一半,广义是指所有神经上皮来源的肿瘤,狭义是指源于各类胶质细胞的肿瘤。
根据CBTRUS统计,恶性胶质瘤约占原发性恶性脑肿瘤的70%,年发生率约为5/100000,每年新发病例超过14000例,65岁以上人群中发病率明显增高。
胶质瘤的死亡率高,据文献报道,中国胶质瘤年发病率为3-6人/10万人,年死亡人数达3万人。
虽然发病率和死亡率,相较于其他肿瘤并不高,但是据柳叶刀子刊《神经病学》(Neurology)研究文章显示,大规模脑肿瘤统计发现,在范围内,中国的发病及死亡人数双双较高。
在2019年V3版的NCCN指南描述,针对Gliomas主要有以下几类生物标志物,依次为:IDH1和IDH2突变、1p19q LOH、MGMT基因的甲基化、ATRX的功能缺失突变、TERT突变、H3F3A突变、BRAF突变和融合、RELA 融合突变、EGFR 跳读和EGFR的扩增。
IDH1和IDH2基因
IDH1和IDH2的突变,会造成D-2-hydroxyglutarate的表达异常,常见的IDH1突变是R132H,推荐IHC检测,如果是阴性的话,建议对IDH1和IDH2全部测序(sanger or NGS)。
科佰生物提供一系列IDH1和IDH2 mutaion的标准品,产品陆续增加中:
1p19q LOH
临床发现不平衡的易位(1;19)(q10;p10)导致整个1p和19q臂的缺失,与IDH的突变密切相关,1p19q LOH和IDH的突变,对临床给药都有明确的帮助。
1p19q LOH标准品,正在研发中。
MGMT promoter的甲基化
MGMT是一个DNA修复酶,对抗一些化疗药物,启动子区域的甲基化可以沉默MGMT基因,导致对化疗药物的敏感。
科佰生物提供的标准品,含有甲基化的详细位点、甲基化程度。
ATRX 基因突变
ATRX是染色体调整蛋白,突变导致的功能缺失会导致ALT(端粒延长替代),临床可用IHC和测序来检测。
科佰提供一系列ATRX的Pathogenic的标准品。
TERT启动子区域突变
TERT是编码端粒酶的催化激活位点,维持细胞分析时端粒的正常长度,TERT的突变发生在非编码区的启动子区域,突变提高了TERT的表达,对临床给药和预后都有很大的指导意义。
H3F3A Mutation
常见的Histone突变是K27M,抑制了H3.3的*基化,其次是G34的突变,在儿童大脑皮层神经胶质瘤也常见。因此临床往往是选择测序,同时能检测K27M和G34。
H3K27M和H3G34标准品,正在研发中。
BRAF突变
BRAF突变,尤其是V600E在很多肿瘤中,都能看到,在胶质瘤中,也同样重要。另外BRAF的fusion也建议被检测,可以检测常见的KIAA1549基因。
BRAF-KIAA1549 Fusion标准品,正在研发中。
RELA Fusion
在儿童上皮神经胶质瘤常见RELA的融合突变,RELA的融合导致NFkB信号通路活化,常见的融合伴侣是C11orf95。
C11orf95-RELA Fusion标准品,正在研发中。
EGFR 跳读和EGFR的扩增
虽然在NCCN指南中没有提及EGFR VIII和EGFR CNV的分子标记,在临床中的作用,但是EGFRvIII是GBM中常见的EGFR突变,在约60-70%EGFR扩增的原发性GBM肿瘤中发现,并且是实验疗法的潜在靶标。
综上,按照NCCN的指南,按照临床的药物,按照伴随诊断的需求,科佰生物开发了针对神经胶质瘤(Glioma)的各种参考品、标准品,适合不同的应用,满足不同客户的需求。
标准品选择好了,接下来就是做性能评价,让我们先学习下指导原则,对于性能评价的规定。
详见《从《指导原则》中分析参考品盘设计》。